Es inevitable que los hijos, a medida que crecen, vayan buscando autonomía. es mucho lo que la Provincia de San Joaquín de Navarra hizo por afianzar exitosamente la Orden en Colombia. Llegó un momento en que los nativos se sintieron suficientemente maduros para formar Provincia aparte. Había doce casas, casi todas florecientes; seminario menor para aspirantes al hábito carmelitano, seminario mayor para estudios de teología y filosofía, número suficiente de religiosos sacerdotes y hermanos legos; vocaciones, porque no había llegado la época de la crisis, en una palabra, todo cuanto se necesitaba para formar Provincia aparte. Ya el Capitulo provincial de Navarra en 1957 preguntaba a los capitulares qué pensaban de la separación de Colombia, quizás como sondeo de la opinión antes de tratar el asunto en serio. En el Capítulo General celebrado en Roma en 1961 vuelve a tocarse someramente el punto y la solución se deja en manos del Definitorio que comienza a entenderse con el Provincial de Navarra.La primera propuesta de éste no satisfizo: quería que aquí se hicieran dos secciones: una para los colombianos, otra para los españoles, pero los primeros querían una sola Provincia con todos los conventos y con todo el personal sin discriminaciones. Llegó el dia en que el proyecto de las dos secciones o semiprovincias quiso ser impuesto a la fuerza y levantó las naturales resistencias: exacerbó los ánimos, causó grandes sufrimientos a los religiosos que buscaban una división equitatita u opinaban distinto a los superiores. Lo único que consiguieron fue retardar un poco la ejecución que al fin vino el 24 de enero de 1962.

Este primer paso daba a seis conventos de la nación, no los mejores cierto grado de independencia más que todo económica e imponía a los demás el deber de ayudar al sostenimiento de los colegios con un porcentaje de sus ingresos. No satisfizo, pero encontró resignación, no aprobación. Durante los dos años que duró el experimento hubo recursos a la Santa sede y los descontentos contaron con el apoyo de los obispos, de superiores de órdenes religiosas, del mismo Vicario que aquí había quedado para gobernarlos.

l Rescripto pontificio de la erección de una provincia autónoma en Colombia con las casas de Bogotá, Leiva, Pereira, Medellín, Monticelo y Sonsón lleva fecha del 25 de abril de 1964. en junio se reunió el primer definitorio, como entonces se llamaba al consejo, y nombró superiores para los conventos y otros cargos; y el primer Capítulo provincial se congregó en Leiva el 11 de agosto de dicho año.

Otro Rescripto firmado el 12 de noviembre de 1968, despues de muchas instancias, agrega a la Provincia de Colombia, que en su primer Capítulo adoptó a Santa Teresita del Niño Jesús como titular, las casas de Palmira, Cúcuta y Cartagena, dejando todavía la de Cali bajo la jurisdicción de Navarra. La unificación total, que restituyó el convento de Cali a la Provincia colombiana es del 18 de marzo de 1970.